疫情防护物资会计分录如下：
1、疫情期间，企业购买防护物资时：
借：管理费用——劳动保护费等（根据使用部门确定相关科目）
应交税费——应交增值税（进项税额）
贷：银行存款
2、疫情期间，企业捐赠防护物资时：
借：营业外支出——捐赠支出
贷：库存商品
应交税费——应交增值税（销项税额）
需注意，疫情期间，公司购买的防疫物资，在无发票的情况下，也是可以正常入账的，但因为进行税前扣除等有关税务处理时，其凭证即发票。在没有发票的情况下，不能正常抵扣。因此，汇算清缴时，需做相应的纳税调增处理。
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