疫情期间单位减免社保会计分录为：
1、疫情期间单位支付减免后的社保款时：
借：应付职工薪酬——社保费（单位部分）（实际缴纳的部分）
其他应付款——社保费（个人部分）（实际缴纳的部分）
贷：银行存款
2、计提减免的单位部分社保时：
借：管理费用——社保费（单位部分）（根据费用所属部门计入相关科目）
贷：应付职工薪酬——社保费（单位部分）
3、发放工资时：
借：应付职工薪酬——应付职工工资
贷：其他应付款——社保费（个人部分）
银行存款
疫情期间单位减免社保，应在支付时，通过“应付职工薪酬”、“其他应付款”等科目核算实际缴纳部分；在计提减免的单位部分社保时，根据费用所属部门计入“管理费用”等相关损益类科目。
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