疫情物资捐赠医院会计处理如下：
1、接受疫情捐赠时:
借：银行存款（或库存现金等科目）
贷：营业外收入——捐赠收入
2、期末结转时：
借：营业外收入——捐赠收入
贷：本年利润
疫情物资捐赠医院会计处理，应当通过“营业外收入”科目以及“银行存款”、“库存现金”等科目进行核算，期末结转至“本年利润”。
“营业外收入”科目，核算企业发生的各项营业外收入，主要包括非流动资产处置利得、非货币性资产交换利得、债务重组利得、政府补助、盘盈利得、捐赠利得等，企业可按营业外收入项目对其进行明细核算。
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