疫情员工体检费用会计处理为：
1、疫情期间支付员工的体检费用并作为福利核算时：
借：管理费用——福利费（根据费用所属部门计入相关科目）
贷：应付职工薪酬——职工福利费
借：应付职工薪酬——职工福利费
贷：银行存款（或库存现金科目）
2、期末结转本年利润时：
借：本年利润
贷：管理费用——福利费（根据费用所属部门计入相关科目）
疫情期间支付员工的体检费用时，可以通过“管理费用”科目及“应付职工薪酬”等科目处理。其中“管理费用”科目用于核算企业为组织和管理企业生产经营所发生的管理支出，“应付职工薪酬”科目用于核算企业根据有关规定应付给职工的各种薪酬。
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