疫情期间员工补助可以根据员工所属的部门计入“管理费用”、“销售费用”或“制造费用”等会计科目中。具体会计处理是企业在确认员工补助时，借记“管理费用——福利费”等相关科目，贷记“应付职工薪酬——职工福利费”科目。企业在下发员工补助时，借记“应付职工薪酬——职工福利费”科目，然后根据补助的形式贷记“银行存款”科目或“库存商品”等科目。
其中企业以非资金形式下发员工补助时，应当注意下发行为是否视同销售并确定是否需要进行进项税额的转出。
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