员工年终奖金计入应付职工薪酬科目，应付职工薪酬是指企业根据有关规定应付给职工的各种薪酬。应付职工薪酬不能简单理解为职工直接领到手的工资，它包括职工工资、奖金、津贴和补贴，职工福利费，医疗、养老、失业、工伤、生育等社会保险费，住房公积金，工会经费，职工教育经费等。
年终奖金相关会计分录如下：
借：销售费用/管理费用等
贷：应付职工薪酬——奖金
发放年终奖金时的分录：
借：应付职工薪酬——奖金
贷：应交税费——应交个人所得税
银行存款
缴纳个人所得税：
借：应交税费——应交个人所得税
贷：银行存款
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