专用发票和专业发票的区别在于，专用发票是针对普通发票而言的发票，而专业发票是针对特定行业的发票。专用发票指“增值税专用发票”，是增值税纳税人销售货物或者提供应税劳务开具的发票，也是购买方支付增值税额并可按照增值税有关规定据以抵扣增值税进项税额的凭证。
而专业发票指国有金融、保险企业的存贷、汇兑、转账凭证，保险凭证；国有邮政、电信企业的邮票、邮单、话务、电报收据；国有铁路、国有航空企业和交通部门、国有公路、水上运输企业的客票、货票等。专业发票适用于某个行业和经营业务。
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