会计电算化系统的内部控制包括：
1、一般控制：指对电算化会计信息系统的组织、开发、应用环境等方面所进行的控制，包含组织控制、系统开发与维护控制、硬件及系统软件控制、系统安全控制以及系统文档控制。
2、应用控制：指对计算机会计信息系统中具体的数据处理功能的控制，包含输入控制、处理控制以及输出控制。
其中会计电算化系统属于会计电算化内容的重要组成部分，而会计电算化指以电子计算机为主，将当代电子技术和信息技术应用至会计实务中的过程。
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