医院会计科目指医院会计核算过程中所应用的会计科目，而根据医院所应用的会计准则或会计制度类型的区别，医院会计核算过程中所应用的会计要素以及会计科目也各不相同。若医院会计应用《政府会计制度》进行会计核算时，其会计科目包括资产类科目、负债类科目、净资产类科目、收入类科目、费用类科目以及其他预算会计科目等；若医院会计应用《企业会计准则》进行会计核算时，其会计科目则包括资产类科目、负债类科目、所有者权益类科目以及成本类科目等。
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