关联方交易审计的重点有：
1、关联方的识别。关联方交易审计的重点和难点在于发现关联方关系，只要找到了所有关联方，审计就有了清晰的线索。注册会计师在签订审计业务约定书和制定审计计划时，要对被审单位的情况进行全面了解，比如了解、评价被审单位识别和处理关联方交易的程序，查阅主要投资者、关键管理人员名单等，从而确定已知或潜在的关联方。
2、关联方交易的识别。判断关联方交易存在的标准不是金额大小，而是会计上的风险和报酬的转移。由于被审单位可能会故意隐瞒关联方交易，因此，注册会计师应实施专门审计程序来识别关联方交易，比如了解是否存在已发生但未进行会计处理的交易，查阅会计记录中数额较大的异常或不常发生的交易等。
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