收付实现制根据货币收支与否来作为收入确认和费用确认和记录的依据，权责发生制以取得收款权利或付款责任作为记录收入或费用的依据。权责发生制和收付实现制计算出来的收入和费用金额不完全相同，计算出来的盈亏数字的准确程度不同，会计核算也不完全相同。
权责发生制使得每期的损益计算反映所有属于本期的真实经营业绩，而收付实现制不能完全做到这一点。因此，权责发生制能更加准确地反映特定会计期间实际的财务状况和经营业绩。但权责发生制也有一定局限性，一个在损益表上看来经营很好、效率很高的企业，在资产负债表上却可能没有相应的变现资金而陷入财务困境，因而需要以收付实现制为编制基础的现金流量表进行补充。
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