科目资金审计的特点有：
1、在审计内容方面强调资金的预算安排和支出情况的全覆盖。科目资金审计关注科目资金预算安排是否科学、可行，注意资金的申请和审批过程是否合规，强调项目单位是否及时完成建设项目、财政投入资金的效益是否发挥；
2、在资金使用效益与政策目标实现方面，重视构建财政审计评价指标体系。科目资金审计构造的评价指标体系遵循着科学性与效用性相结合、相关性与系统性相结合、定量指标和定性指标相结合、兼容性与针对性相结合的原则。
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