计算机辅助审计包含两个层次的内容，第一个层次是在审计业务中利用电子表格、数据库中的一些功能，或审计人员自编的一些小程序，帮助审计人员计算、复算、复核、分析审计数据，主要目的是节约审计时间、提高效率、增加准确性以及减轻劳动量。例如，用电子表格软件审核工资表，复算固定资产折旧提取的正确性等。
第二个层次是指利用专门的辅助审计软件进行项目审计，一方面是编制专门的审计汇总软件，进行审计情况汇总，另一方面是协助审计人员对专门项目，用专门的审计方法进行比较全面、系统的审计，比如预算执行审计软件、投资审计软件等。
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