平行记账与双分录两者的区别在于：双分录是根据不同的会计要素进行分类，然后对应不同要素按照权责发生制及收付实现制进行相应的会计处理；平行记账无需分类会计要素，将所有业务通过权责发生制以及收付实现制同时进行登记。
平行记账是执行新政府会计制度改革以来提出的应用于新政府会计制度的记账方法，指的是针对同一笔经济业务既要按照权责发生制进行登记也要按照收付实现制进行登记。双分录指的是对行政、事业单位发生的资产、负债等会计业务采用权责发生制为基础，对收入、支出等会计业务采用收付实现制为基础的会计核算。
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