财政补助收入是指事业单位直接从财政部门取得的和通过主管部门从财政部门取得的各类事业经费，包括正常经费和专项资金。一般通过“财政补助收入”科目进行核算。
1、实行国库统一收付制度，财政直接支付的核算
（1）由财政直接支付的工资：
借：事业支出
贷：应付工资
借：应付工资
贷：财政补助收入
（2）由财政直接支付的购买材料、服务的款项：
借：材料
事业支出
贷：财政补助收入
（3）由财政直接支付的购置固定资产的款项：
借：事业支出
贷：财政补助收入
借：固定资产
贷：固定基金
2、实行国库统一收付制度，财政授权支付的核算
（1）收到“授权支付到账通知书”后，根据通知书所列数额：
借：零余额账户用款额度
贷：财政补助收入
（2）事业单位购买物品、服务等支用额度时：
借：事业支出、材料
贷：零余额账户用款额度
（3）属于购入固定资产的：
借：固定资产
贷：非流动资产基金——固定资产
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